El intendente de Encarnación, Alfredo Luis Yd, presentó al fiscal general del Estado una denuncia penal contra cuatro exintendentes de esta localidad que serían responsables de la malversación de más de G. 2.000 millones, cuyo monto fue utilizado sin supervisión para conmemorar los 400 años de fundación de la ciudad. Unos G. 37.000 millones de royalties no utilizaron correctamente.
La Municipalidad de Encarnación desarrolla proyectos productivos destinados a pequeñas granjas, con el objetivo de mejorar las condiciones de vida de las familias rurales del distrito y generar fuentes de trabajo. Los rubros enfocados son huertas familiares, cría de ganado menor, producción de peces en estanques, además de cultivo de frutas y plantas medicinales.