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En tierra de los colorados, Juan Carlos Meza obtuvo 5.345 votos. Por su parte, Richard Ramírez, 4.203 votos, según cómputos parciales. Meza logró su reelección al frente de la municipalidad de San Juan Bautista.
En San Ignacio ganó Carlos Afara (ANR ), que obtuvo 3.907 votos frente a Rosana Rolandi (PLRA), quien obtuvo 2.837 votos. En San Miguel triunfó Julio César Ramírez (ANR) con 1.697 votos. En Villa Florida ganó Michel Flores (ANR) con 1.296 votos y Abel Gonzalez Ortiz (PLRA), con 1.141 votos.
En Santa María, los colorados recuperan la intendencia con la victoria de Ramón Sanabria (ANR), quien se alzó con 2.348 votos. En Santa Rosa volvió a ganar Arnaldo Valdez (PLRA), quien obtuvo 4.689 votos. En San Patricio triunfó la Alianza, representada por el candidato Fabián Almada, con 1.483 votos, sobre el candidato colorado José Ignacio Cristaldo (ANR), con 1.192 votos.
En Santiago ganó Ignacio Larre (PLRA) con 2.244 votos, mientras que en Ayolas lo hizo Carlos Duarte (ANR), con 4.015 votos. En Yabebyry se impuso Ignacio Brizuela (ANR) con 990 votos.
Estos datos revelan que en el departamento de Misiones la ANR se apoderó de seis municipios: Villa Florida, San Miguel, San Ignacio, Santa María, Ayolas y Yabebyry, mientras que se quedó con San Juan Bautista, Misiones, Santa Rosa y Santiago. La Alianza marcó la diferencia en San Patricio.