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La trama gira en torno a una pequeña cebra, nacida con rayas solo en la mitad del cuerpo, que es despreciada por su supersticiosa manada y es acusada de ser la responsable de la sequía que afecta al territorio donde viven. Junto a una extravagante avestruz y un descarado ñu, Khumba se embarca en una misión a través del desierto del Gran Karoo para encontrar un legendario pozo de agua donde las primeras cebras recibieron sus rayas.
A lo largo del camino, el trío se encontrará con coloridos personajes pero, antes de volver a su manada, Khumba tendrá que enfrentarse cara a cara con un leopardo amenazante.
El largometraje, de unos 85 minutos de duración y destinado a toda la familia, contó en su versión inglesa con las voces de Steve Buscemi, Liam Neeson, Jake T. Austin, Laurence Fishburne, entre otros.