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En forma general para clasificar en reinos a los seres vivos los criterios son:
a. Complejidad de su estructura (unicelulares o pluricelulares; eucariotas o procariotas).
b. Régimen nutricional: si elaboran su propio alimento (autótrofos) o se alimentan de otros (heterótrofos).
c. Relaciones evolutivas.
Luego de la clasificación en 5 reinos de Whitaker, con las modificaciones de Woese, Margulis y otros se incorporó el Dominio Archaea y el sexto reino: Arqueobacterias.