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Alderete inició su vida política en la década del 80. Fue consejero del IPS desde 1982. En 1993 llegó a la Cámara de Senadores y declaraba un patrimonio de unos G. 185 millones y una deuda de G. 20 millones. En 2003 ingresó a Yacyretá (EBY), pero antes fue jefe de campaña de Nicanor Duarte Frutos. Desde agosto del 2003, Alderete fue retribuido con el cargo de ministro del MOPC. En marzo del 2006 asumió la presidencia de la ANR ya que Duarte Frutos no podía hacerlo por postularse inconstitucionalmente. En el 2007 fue precandidato a la presidencia de la República junto con Mario Abdo Benítez (hijo), actual Presidente de la República. Desaparecido por años, volvió como jefe de campaña del actual Ejecutivo. Abdo Benítez lo premió como director paraguayo de Itaipú.
Entre 1990 y el 2000, Alderete fue investigado por presunto enriquecimiento ilícito debido a su repentino bienestar económico. Según antecedentes, entre 1993 y 2003, su patrimonio tuvo un crecimiento de 1.562%.