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Vara fue capellán del Batallón de Comunicaciones 181 de Bahía Blanca, en la provincia de Buenos Aires, y lo estaba buscando Interpol. Dada su avanzada edad y deterioro de salud, el magistrado dispuso su prisión domiciliaria mientras se tramita su extradición.
Por ello, el religioso fue trasladado de nuevo hasta un albergue para curas jubilados, donde reside en Ciudad del Este. El sacerdote se había fugado de Argentina cuando empezaba la causa penal por el Batallón de Comunicaciones 181 en Bahía Blanca (685 km al sur), en la que está imputado por violaciones a los derechos humanos, pero nunca pudo ser interrogado por los fiscales.
Vara, capellán del V Cuerpo de Ejército entre 1971 y 1979, está acusado entre otros cargos de privación ilegal de libertad, amenazas y violencia, homicidio agravado por alevosía, desaparición forzada e imposición de tormentos.
El más conocido de los casos que involucran a Vara es el de un grupo de estudiantes que fueron secuestrados en diciembre de 1976 y torturados durante un mes en el centro clandestino de detención conocido como “La Escuelita”.