La novel entidad -que se abocará durante toda la temporada 2016 a su preparación- tiene su sede en la Villa Solidaridad 1, barrio San Miguel de Valle Pucú, por lo que en breve serán tres los representantes de esa compañía en el circuito frutillero, después del 24 de Setiembre (campeón 2014) y el 8 de Setiembre (monarca 2013).

El Atlético San Miguel cuenta con la presidencia de Alberto David Jiménez Santacruz, exfutbolista de 34 años, de origen sapuqueño.