En septiembre del 2020, Éver Noguera logró trabar su causa en la justicia gracias al apoyo que le dieron sus colegas al solicitar ante el pleno el rechazo de su pedido de desafuero requerido por el juez Penal de Garantías Agustín Delmás.
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Noguera pidió a sus colegas rechazar el pedido de desafuero ante la supuesta falta de “garantía constitucional que tiene un ciudadano electo antes de someterse ante la justicia”. Cuestionó que antes de quedar firme la imputación en su contra, ya solicitaron su desafuero.
El diputado alegó falta de garantía, sin embargo en dos oportunidades ratificó su confianza a la fiscala general del Estado, Sandra Quiñónez, al rechazar y mandar al archivo el pedido de juicio político que los opositores presentaron en su contra por mal desempeño de funciones.
Su imputación
Fue imputado por administración en provecho propio y asociación criminal en el supuesto caso de corrupción en la compra de la merienda escolar en Guairá.