Los hospitales funcionales en Boquerón están ubicados en Filadelfia, Loma Plata y Neuland. Son privados, pero Salud Pública terceriza el servicio mediante un convenio. Hay dos hospitales públicos: en Mariscal Estigarribia está el Hospital Regional y en Villa Choferes del Chaco, el Materno Infantil. Según reportes, en todos faltan unidades de terapia intensiva y terapistas para atender a los infectados en estado grave. La ocupación de camas está al tope y los puestos de salud atienden solo casos leves o ambulatorios.
El director del materno infantil de Villa Choferes del Chaco, Diego Scalzadona, lamentó: “no hay terapia intensiva en el Chaco Central en el sistema público, y tengo entendido que en el privado tampoco hay terapistas. Eso es lo que siempre recalco, terapia no es el equipamiento, el 80% de la terapia es el personal, depende del profesional médico y eso es lo que está faltando en el Chaco Central, profesionales terapistas (...) Esto es muy real y está matando mucha gente”.