Por todos estos antecedentes la fiscalía lo imputó y luego acusó por lavado de dinero y asociación criminal con vínculos con el narcotráfico y se pidió su juicio oral para él y los otros 24 procesados que tiene el expediente.
Quintana estuvo preso desde el 21 de setiembre de 2018 hasta el 6 de julio de 2019, día en que la exjueza Magdalena Narváez lo liberó. Sin embargo, la Cámara de Apelación anuló el fallo y el 29 de noviembre de 2019 se volvió a ordenar su detención y está preso en la cárcel militar de Viñas Cue.
Gracias a las grabaciones que interceptó la inteligencia de la Senad, se pudo saber que Cabaña aportó dinero para la campaña electoral que llevó a Quintana para ser diputado por el departamento de Alto Paraná.